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Nature Genetics 55권, 973~983페이지(2023)이 기사 인용

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측정항목 세부정보

독특한 조직 특이적 메커니즘은 공복 상태와 식후 상태에서 인슐린 작용을 중재합니다. 이전의 유전학 연구는 간 인슐린 작용이 지배적인 공복 상태에서의 인슐린 저항성에 주로 초점을 맞춰왔습니다. 여기서 우리는 3개 조상 그룹의 55,000명 이상의 참가자를 대상으로 포도당 투여 후 2시간에 측정된 인슐린 수치에 영향을 미치는 유전적 변이를 연구했습니다. 우리는 이전에 챌린지 후 인슐린 저항성과 관련이 없었던 10개의 새로운 유전자좌(P < 5 × 10-8)를 확인했으며, 그 중 8개는 공동 위치 분석에서 제2형 당뇨병과 유전적 구조를 공유하는 것으로 나타났습니다. 우리는 배양된 세포에서 관련 유전자좌의 하위 집합에서 후보 유전자를 조사하고 근육과 지방의 식후 포도당 흡수에 중요한 포도당 운반체인 GLUT4의 발현이나 수송에 새로 연루된 9개의 후보 유전자를 식별했습니다. 식후 인슐린 저항성에 초점을 맞춤으로써 우리는 공복 혈당 특성에 대한 연구에서 적절하게 포착되지 않는 제2형 당뇨병 유전자좌의 작용 메커니즘을 강조했습니다.

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GWAS 요약 통계는 MAGIC 조사관에서 확인할 수 있습니다.

웹사이트(https://magicinvestigators.org/downloads/) 및 GWAS 카탈로그(https://www.ebi.ac.uk/gwas/home): GCST90267567, GCST90267568, GCST90267569, GCST90267570, GCST90267571, GCST90267572, GCST90267 573, GCST90267574, GCST90267575, GCST90267576, GCST90267577 및 GCST90267578.

Fenland 코호트의 데이터는 연구 웹사이트(https://www.mrc-epid.cam.ac.uk/research/studies/fenland/information-for-researchers/)를 통해 특정 과학적 목적을 위해 선의의 연구자가 요청할 수 있습니다. . 데이터는 기관 데이터 공유 계약을 통해 공유되거나 데이터 전송 없이 원격으로 분석이 수행되도록 준비됩니다.

유전적 위험 점수 연관 분석에 사용되는 모든 데이터는 신청 시 영국 Biobank에서 이용 가능합니다(https://www.ukbiobank.ac.uk). 이 원고에 포함된 영국 바이오뱅크의 모든 분석은 신청서 44448에 따라 수행되었습니다. RISC 연구 및 데이터 가용성에 대한 자세한 내용은 http://www.egir.org/egirrisc/에서 확인할 수 있습니다. 유전자형-조직 발현(GTEx) 프로젝트는 국립 보건원 소장실의 공동 기금과 NCI, NHGRI, NHLBI, NIDA, NIMH 및 NINDS의 지원을 받았습니다. 이 원고에 설명된 분석에 사용된 데이터는 GTEx 포털(https://www.gtexportal.org/home/) 및 dbGaP 가입 번호 phs000424.v8.p2에서 얻을 수 있습니다. ENCODE(https://www.encodeproject.org/) 및 Roadmap Epigenomics Consortium(https://egg2.wustl.edu/roadmap/web_portal/)의 게놈 규제 주석은 UCSC Genome Browser(//genome. ucsc.edu). 이 연구에 사용된 공개된 차별화된 3T3-L1 RNA 시퀀싱 데이터는 GEO 가입 GSE129957(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)에서 확인할 수 있습니다. 이 문서에는 원본 데이터가 제공됩니다.

이전에 보고되지 않은 사용자 정의 코드나 알고리즘은 결과를 생성하는 데 사용되지 않았습니다. 데이터 분석에는 다음 소프트웨어 및 패키지가 사용되었습니다. METAL v.2011-03-25 (http://csg.sph.umich.edu/abecasis/Metal/download/), random-metal v.2017-07-24 (https://github.com/explodecomputer/random-metal), 연계 불균형 점수 회귀 v.1.0.1 (https://github.com/bulik/ldsc), R v.3.6.0 및 v.4.0. 3 (https://www.r-project.org/). R 패키지 coloc v.5.1.0(https://cran.r-project.org/web/packages/coloc/).

0.05)./p> 0.05). Abbreviations denote: IFC_OGTT – IFC calculated using OGTT measures, ISI_OGTT – Modified Stumvoll ISI calculated using OGTT measures. M_I – M/I index of insulin sensitivity measured by clamp. InsC0c – insulin measured at 0 min during clamp. InsO0c—insulin measured at 0 min during OGTT. InsC120c—insulin measured at 120 min during clamp. InsO120c—insulin measured at 120 min during OGTT. InsC_20c—insulin measured at 20 min before clamp. EGP_B—basal glucose production, EGP_SS—glucose production during clamp, GCR_B—basal glucose clearance, ml/min/kg lean body mass, GCR_SS—steady state glucose clearance, ml min−1 kg−1 lean body mass, icl_clamp—peripheral insulin clearance (1 min−1 m−2), icl_OGTT—endogenous ‘pre-hepatic’ clearance during the OGTT, hie_0—hepatic insulin extraction during clamp, OGIS—oral glucose insulin sensitivity index (ml min−1 m−2). ISR5dr—insulin secretion 5 mM glucose, beta cell dose response (pmol min−1 m−2). ISR0 basal insulin secretion (pmol min-1m-2). ISRtot—total insulin secretion (nmol m−2)./p>

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